Sobotište wird erstmals in einem Dokument aus dem Jahr 1251 als Terra Zabodycha erwähnt – das Land Sobotište, das ein Marktplatz auf einer Fernhandelsroute war. Die Märkte fanden hier samstags statt. Sobotište war zuerst ein Teil der Grenzburg Bana und von der zweiten Hälfte des 13ten Jahrhunderts gehörte es zur Burg Branč. František Ňári (+ 1551) heiratete Elisabeth von Korlátka und verband beide Teile des Gutes. Ihre Ehe blieb jedoch kinderlos. Nach seinem Tod wurde das Eigentum an dem Anwesen auf ein Kompositionsunternehmen (Verwaltung mehrerer Eigentümer) übertragen, an dem die Familie Ňári den größten Anteil hatte.
Die Stadt Sobotište (zusammen mit Senica) war eines der Zentren des Branč- Gutes. Mehrere an das Herrenhaus gebundene Edelmann- Familien (z. B. Ňáry, Pongrác, Vietoris) bauten hier ihre Kurien. Zu der Stadt gehörten auch Streusiedlungen „Kopanice“, die von 17ten Jahrhundert besiedelt wurden. Laut der Volkszählung gab es im Jahr 1752: 152 Familien in der Stadt, 134 Familien in den umliegenden Streusiedlungen. Im Jahr 1787 hatte das Dorf 3245 Einwohner und 405 Häuser.
Die Mehrheit der Bevölkerung meldete sich zum Luthertum, das sich von der zweiten Hälfte des 16ten Jahrhunderts im Brač-Gut vor allem dank der Familie Ňáry verbreitete. Zu den mehrheitlichen Protestanten kamen in der zweiten Hälfte der 20er Jahren des 17ten Jahrhunderts tschechische und mährische Exilanten, die sich der Einheit der Brüder anschlossen. Natürlich außer Protestanten lebten in der Stadt auch Neo-Baptisten und Katholiken. Am Ende des 17ten Jahrhunderts wurde die verschiedene religiöse Komposition durch Juden bereichert.
Die meisten Familien verdienten ihren Lebensunterhalt mit der Bewirtschaftung von Land, der Zucht von Rindern und Schafen. Neben der Landwirtschaft, die wichtigste Ernährungsquelle darstellte, gab es in Sobotište auch Handwerker. Im 17ten Jahrhundert wurde eine gemeinsame Gilde von Metzgern aus Sobotište und Senica gegründet. Im Jahr 1765 gründete Graf Jozef Ňáry in Sobotište eine Wollverarbeitungsmanufaktur. Dank des evangelischen Lehrers Samuel Jurkovič war Sobotište während der Wiederbelebungszeit eines der führenden Kulturzentren der Region.
Im Herbst 1848 flohen viele Beamten aus Sobotište und Umgebung aufgrund des militärischen Erfolgs der Hurbanisten in Brezová pod Bradlom. Mehrere Bewohner von Sobotište schlossen sich den Freiwilligen an.
In der Zeit nach der Revolution wurde das Branč-Gut verfallen. Auf dem ehemaligen Anwesen von Branč-Gut bewirtschafteten in der Form von Großgrundstücken mehrere Grundbesitzer zum Beispiel wie die Familie Kuffner, die im Sobotište-Kataster weitläufige Grundstücke besaß. Nach der Gründung der Tschechoslowakischen Republik wurde ihr Anwesen parzelliert.
